Mimotopo,

Un mimotopo es una macromolécula, a menudo un péptido, que imita la estructura de un epítopo. Debido a esta propiedad que provoca una respuesta de anticuerpos similares a los provocados por el epítopo. Un anticuerpo para un antígeno determinado epítopo reconocerá un mimótopo que imita ese epítopo. Mimotopos comúnmente se obtuvieron a partir de bibliotecas de presentación de fagos a través de biopanning. Se están desarrollando vacunas mimótopos utilizan.

Cuando el término mimotope fue acuñado por primera vez por Mario Geysen en 1986, fue utilizado para describir péptidos que imitan epítopo. Sin embargo, este concepto se ha ampliado para referirse péptido imitador de todos los tipos de sitios de unión. A medida que el sitio de unión de imitar, análisis mimotopo ha sido ampliamente utilizado en epítopos de mapeo, la identificación de meta de la droga e inferir redes de interacción de proteínas. Además, mimotope también ha demostrado su potencial en el desarrollo de nuevos diagnósticos, terapias y vacunas. Además, las afinidades especiales mediadas por mimótopos a varios semiconductores y otros materiales que se han mostrado prometedores muy alentadores in new nuevos estudios de materiales y energía. La recopilación de información sobre mimótopos en una base de datos especial, por lo tanto merece. En 2010, la base de datos MimoDB versión 1.0 fue lanzado. Tenía 10.716 péptidos agrupados en conjuntos de 1229. Estos péptidos se extrajeron de biopanning resultados de bibliotecas de péptidos aleatorios en fagos reportados en 571 papeles. La base de datos MimoDB se ha actualizado a la versión actual 2.0 hace muy poco. En la versión 2.0, tiene 15.633 péptidos obtenidos de 849 artículos, agrupados en 1.818 juegos. Además de los datos básicos de paneo experimentos y sus resultados, amplia información de antecedentes en el blanco, se incluyen plantillas, bibliotecas y estructura. Un punto de referencia acompañado también ha sido compilada para bioinformáticos para desarrollar y evaluar sus nuevos modelos, algoritmos y programas. Además, la base de datos MimoDB proporciona herramientas para búsquedas simples y avanzadas, la estructura de visualización, BLAST y vista la alineación sobre la marcha. Los biólogos experimentales pueden utilizar fácilmente la base de datos como un control virtual para excluir posibles péptidos de objetivos no relacionados. La base de datos MimoDB está disponible gratuitamente.

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